স্ট্যান্ডার্ড অ্যামিনো অ্যাসিড
অমিতো অ্যাসিডগুলির স্ট্যান্ডার্ড (বা সাধারণ) শ্রেণিবদ্ধ করার জন্য সবচেয়ে দরকারী শিষ্টাচারগুলির মধ্যে একটি আর গ্রুপের (যেমন, সাইড চেইন) মেরুতা (যা বৈদ্যুতিক চার্জের বন্টন) এর উপর ভিত্তি করে।
প্রথম দল: ননপোলার অ্যামিনো অ্যাসিড
গ্রুপ আই অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি হ'ল গ্লাইসিন, অ্যালানাইন, ভালাইন, লিউকিন, আইসোলেইসিন, প্রোলিন, ফেনিল্লানাইন, মেথিওনাইন এবং ট্রিপটোফান। এই অ্যামিনো অ্যাসিডগুলির আর গ্রুপগুলিতে হয় আলিফ্যাটিক বা সুগন্ধযুক্ত গ্রুপ রয়েছে। এটি তাদের হাইড্রোফোবিক করে তোলে ("জল ভয়")। জলীয় দ্রবণগুলিতে, গ্লোবুলার প্রোটিনগুলি এই হাইড্রোফোবিক সাইড চেইনগুলিকে প্রোটিনের অভ্যন্তরে সমাহিত করতে ত্রি-মাত্রিক আকারে ফোল্ড করবে। গ্রুপ আই অ্যামিনো অ্যাসিডের রাসায়নিক কাঠামো হ'ল:
আইসোলিউসিন লিউসিনের একটি আইসোমার এবং এটিতে দুটি চিরাবল কার্বন পরমাণু রয়েছে। প্রোলিন স্ট্যান্ডার্ড অ্যামিনো অ্যাসিডগুলির মধ্যে স্বতন্ত্র যা এতে ফ্রি-এমিনো এবং ফ্রি car-কারবক্সিল গ্রুপ উভয়ই থাকে। পরিবর্তে, এর সাইড চেইন একটি চক্রাকার কাঠামো গঠন করে কারণ প্রোলিনের নাইট্রোজেন পরমাণু দুটি কার্বন পরমাণুর সাথে সংযুক্ত থাকে। (কড়া কথায় বলতে গেলে, এর অর্থ হ'ল প্রলাইন এমিনো অ্যাসিড নয় বরং একটি im-imino অ্যাসিড।) নাম হিসাবে বোঝা যায় ফেনিল্লানাইন অ্যালানাইনের সাথে যুক্ত একটি ফিনাইল গ্রুপ নিয়ে গঠিত। সালফিউর পরমাণুর অধিকারী দুটি অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে মেথোনিন হ'ল। প্রায় সবসময় অ্যামিনো অ্যাসিড শুরু করা হওয়ায় প্রোটিন জৈব সংশ্লেষ (অনুবাদ) এর ক্ষেত্রে মেথোনিন কেন্দ্রীয় ভূমিকা পালন করে। মেথোনিন বিপাকের জন্য মিথাইল গ্রুপও সরবরাহ করে। ট্রাইপ্টোফানে একটি ইন্ডোলের রিং থাকে যা অ্যালানাইল সাইড চেইনের সাথে সংযুক্ত থাকে।
দ্বিতীয় গ্রুপ: পোলার, আনচার্জড অ্যামিনো অ্যাসিড
গ্রুপ II অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি হ'ল সেরিন, সিস্টাইন, থ্রোনাইন, টাইরোসিন, অ্যাস্পারাজিন এবং গ্লুটামিন। এই গোষ্ঠীর পাশের চেইনগুলি কার্যকরী গোষ্ঠীগুলির বর্ণালী ধারণ করে। তবে বেশিরভাগের কমপক্ষে একটি পরমাণু (নাইট্রোজেন, অক্সিজেন বা সালফার) রয়েছে যা জল এবং অন্যান্য অণুতে হাইড্রোজেন বন্ধনের জন্য ইলেকট্রন জোড়া পাওয়া যায়। গ্রুপ II অ্যামিনো অ্যাসিডের রাসায়নিক কাঠামো হ'ল:
দুটি অ্যামিনো অ্যাসিড, সেরিন এবং থ্রোনিনে অ্যালিফেটিক হাইড্রোক্সিল গ্রুপ থাকে (যা হাইড্রোজেন পরমাণুর সাথে জড়িত অক্সিজেন পরমাণু, ―OH হিসাবে প্রতিনিধিত্ব করে)। টায়রোসিন সুগন্ধযুক্ত রিংয়ে একটি হাইড্রোক্সিল গ্রুপ ধারণ করে, এটি একটি ফেনল ডেরাইভেটিভ করে তোলে। এই তিনটি অ্যামিনো অ্যাসিডের হাইড্রোক্সিল গ্রুপগুলি একটি গুরুত্বপূর্ণ ধরণের উত্তরোত্তর সংশোধন সাপেক্ষে: ফসফরিলেশন (ননস্ট্যান্ডার্ড অ্যামিনো অ্যাসিডের নীচে দেখুন)। মেথিওনিনের মতো সিস্টাইনেও সালফার পরমাণু থাকে। মিথেনিনের সালফার পরমাণুর বিপরীতে সিস্টাইনের সালফার খুব রাসায়নিকভাবে বিক্রিয়াশীল (সিসটাইন জারণের নীচে দেখুন)। অ্যাস্পারাগেইন, প্রথমে অ্যাসপারাগাস থেকে বিচ্ছিন্ন এবং গ্লুটামাইন উভয়তে অ্যামাইড আর গ্রুপ থাকে। কার্বনিল গ্রুপ হাইড্রোজেন বন্ড গ্রহণকারী হিসাবে কাজ করতে পারে এবং অ্যামিনো গ্রুপ (এনএইচ 2) হাইড্রোজেন বন্ড দাতা হিসাবে কাজ করতে পারে।
গ্রুপ তৃতীয়: অ্যাসিডিক অ্যামিনো অ্যাসিড
এই গোষ্ঠীর দুটি অ্যামিনো অ্যাসিড হ'ল এস্পারটিক অ্যাসিড এবং গ্লুটামিক অ্যাসিড। প্রত্যেকের পাশের চেইনে একটি কার্বোঅক্সিলিক অ্যাসিড রয়েছে যা এটি অ্যাসিডিক (প্রোটন-দান) বৈশিষ্ট্য দেয়। শারীরবৃত্তীয় পিএইচ এর একটি জলীয় দ্রবণে, এই অ্যামিনো অ্যাসিডের সমস্ত তিনটি কার্যকরী গোষ্ঠী আয়নিত করবে, এইভাবে সামগ্রিকভাবে −1 চার্জ দেবে − আয়নিক ফর্মগুলিতে অ্যামিনো অ্যাসিডগুলিকে অ্যাস্পারেট এবং গ্লুটামেট বলা হয়। গ্রুপ তৃতীয় অ্যামিনো অ্যাসিডের রাসায়নিক কাঠামো হ'ল
অ্যাস্পার্টেট এবং গ্লুটামেটের পাশের চেইনগুলি আয়নিক বন্ডগুলি ("লবণের সেতু") তৈরি করতে পারে এবং তারা হাইড্রোজেন বন্ড গ্রহণকারী হিসাবেও কাজ করতে পারে। কাঠামোগত বা কার্যকরী উদ্দেশ্যে ধাতু আয়নগুলি ("ধাতব প্রোটিন") কে আবদ্ধ করে এমন অনেক প্রোটিন এস্পার্টেট বা গ্লুটামেট সাইড চেইন বা উভয় সমন্বিত ধাতব-বাধ্যতামূলক সাইটগুলির অধিকারী। ফ্রি গ্লুটামেট এবং গ্লুটামাইন অ্যামিনো অ্যাসিড বিপাকের কেন্দ্রীয় ভূমিকা পালন করে। কেন্দ্রীয় স্নায়ুতন্ত্রের মধ্যে গ্লুটামেট হ'ল সর্বাধিক প্রচুর উত্তেজনাপূর্ণ নিউরোট্রান্সমিটার।
