1 জুলাই, 1823 সালে, আমেরিকা যুক্তরাষ্ট্রের শাসনের অধীনে দুই বছর পর তার স্বাধীনতা ঘোষণা করে এবং মধ্য আমেরিকার ইউনাইটেড প্রদেশগুলি গঠন করে। 1838 সালে হন্ডুরাস ইউনাইটেড প্রদেশগুলি থেকে নিজেকে আলাদা করে নিল যদিও এটি ফেডারেশন পতাকা ব্যবহার অব্যাহত রেখেছে, যা ১৮৩৩ সাল থেকে স্থির হয়েছিল। গৃহযুদ্ধ ও বিদেশ থেকে আক্রমণগুলি হন্ডুরাসকে ১৮৪০ থেকে ১৮62২ সালের মধ্যে জর্জরিত করেছিল। পরবর্তী শান্তির দিকে, মনোযোগ যথাযথ জাতীয় দিকে নিবদ্ধ ছিল প্রতীক। ফেব্রুয়ারী 16, 1866 এ সিদ্ধান্ত নেওয়া হয়েছিল যে মধ্য আমেরিকার নীল-সাদা-নীল পতাকাটি ধরে রাখা হবে তবে একটি স্বতন্ত্র নতুন কেন্দ্রীয় প্রতীক সহ। নির্বাচিত নকশায় পাঁচটি নীল তারা রয়েছে, যা মধ্য আমেরিকান ফেডারেশনের পাঁচ সদস্যের প্রতীকী (হন্ডুরাস, এল সালভাদোর, নিকারাগুয়া, কোস্টারিকা এবং গুয়াতেমালা)। সেই নকশায় কোনও নৌ যুদ্ধযান চালিয়ে পতাকাটি যখন প্রেরণ করা হয়েছিল তখন জাতীয় অস্ত্রের জাতীয় কোট যুক্ত করতে হবে।
আমেরিকা যুক্তরাষ্ট্র গৃহযুদ্ধে তার জাতীয় ইউনিয়ন সংরক্ষণ করার এক বছরেরও কম সময়ের মধ্যে হন্ডুরান পতাকাটি গৃহীত হয়েছিল। একই যুগে, এল সালভাদোর তারার এবং স্ট্রিপসের পরে লাল এবং নীল রঙের বিপরীত চিত্রযুক্ত একটি পতাকা গ্রহণ করেছিল। এটি সম্ভবত সম্ভব যে হন্ডুরাস গৃহীত তারকারা, তার তিনটি স্ট্রাইপ সহ, মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের পতাকার একটি সূক্ষ্ম রেফারেন্স গঠন করেছিল (যাতে প্রতিটি তারা একটি রাষ্ট্রকে সংযুক্ত করে তোলে) বিশেষত অব্যাহত সমর্থনের আলোকে প্রস্তাবিত কেন্দ্রীয় আমেরিকান হন্ডুরান বুদ্ধিজীবী এবং রাজনীতিবিদদের মধ্যে ফেডারেশন পাওয়া যায়, তাদের প্রকাশ্যে অন্তত বিবৃতিতে। পাঁচটি দেশকে পুনরায় সংশ্লেষ করার বেশ কয়েকটি অবহেলামূলক প্রচেষ্টা 19 তম 19 তম এবং 20 শতকের শুরুর দিকে হয়েছিল, প্রতিবার একটি অনুভূমিক নীল-সাদা-নীল পতাকার নীচে। (এল সালভাডর, গুয়াতেমালা, কোস্টা রিকা এবং নিকারাগুয়ার পতাকাগুলির ইতিহাসও দেখুন))
