যদিও উনিশ শতকের সময়ে পানামায় এটি কলম্বিয়ার অংশ ছিল সেখানে বিচ্ছিন্নতাবাদী আন্দোলন ছিল, কিন্তু কোনও স্বীকৃত পানামানিয়ান পতাকা ছিল না। ১৯০৩ সালে, কলম্বিয়ার সেনেট যখন আমেরিকা যুক্তরাষ্ট্রের সাথে পানামা খাল নির্মাণের জন্য প্রস্তাবিত চুক্তিকে প্রত্যাখ্যান করেছিল, আমেরিকানরা পানামানিয়ান স্বাধীনতা আন্দোলনে সহায়তা করেছিল এবং পানামা প্রজাতন্ত্র গঠিত হয়েছিল।
প্রাথমিকভাবে একটি পতাকা নকশার প্রস্তাব দেওয়া হয়েছিল যা কলম্বিয়ার পতাকার রঙ ব্যবহার করে। এটিতে নীল ক্যান্টনের সাথে দুটি সংযুক্ত হলুদ সূর্যের সমান আনুভূমিক রেখাচিত্রমালা এবং ভবিষ্যতের পানামা খাল দ্বারা গ্রহের দুটি অংশকে সংযুক্ত করার প্রতীক। অবশেষে নির্বাচিত পতাকা নকশাটি জুলাই 4, 1904 এ অফিসিয়াল হয়ে ওঠে; এটি দুই তারা দিয়ে ত্রৈমাসিক বিভক্ত ছিল। দায়ী প্রতীকবাদ হ'ল সরকারে দুটি প্রধান রাজনৈতিক দলের বিকল্প (মূলত লাল ছিল উদারপন্থীদের জন্য, নীল রক্ষণশীলদের জন্য নীল এবং তাদের মধ্যে শান্তির জন্য সাদা), যদিও বর্ণ এবং তারাগুলি পতাকাটির প্রভাবের দিকে স্পষ্টভাবে ইঙ্গিত করেছিল। যুক্তরাষ্ট্র. পানামানিয়ান পতাকাটি ডিজাইন করেছিলেন নতুন প্রজাতন্ত্রের প্রথম রাষ্ট্রপতির পুত্র ম্যানুয়েল ই। আমাদোর।
